1) 为门徒祈祷（约17：1至26）
有解经家认为约翰福音十七章，是主耶稣以自己为大祭司，站在神和人的中间，为自己及属神的子民献上的祷告。主的祷告可分为三个主要的部分：第一，先为自己祷告（17：1至5）。第二，为门徒献上祷告（17：6至19）。第三，为神家里的成员代祷（17：20至26）。
为自己祷告（17：1至5）
世人喜欢虚浮的荣耀，想得着人的称赞及抬举，这都是属于短暂虚浮的荣耀。主耶稣在此祷告，在短短五节的经文中，「荣耀」出现了好几次。主不是求人世间而来的荣耀，乃是专一的荣耀父神，并且与父同享荣耀。
主本来的权柄（17：2至3）
主耶稣本拥有管理宇宙万有的权柄（17：2），并且拥有赐下永生的权能（17：3）。留意主对「永生」的定义，「认识你独一的真神，并且认识你所差来的耶稣基督，这就是永生。」这是对于「永生」一个极其独特及简单扼要的解释。
已经荣耀了父（17：4）
主表明父所交托的事，已经成就了，这是忠心管家的表现；并且在地上已荣耀了父神。基督在世上最大的职事，是要显明父神（1：18），通过言与行，借着在十架上的舍身流血，叫人认识天上极其荣耀的父神，这就是完成了祂的使命，把父该得的荣耀及称赞归给祂。
为门徒代祷（17：6至19）
忠于父所托（17：6至8）
基督对着神定意拣选的人，已把父的名向他们显明（17：6）；换句话说，主向这些蒙拣选的人作极有效的见证。此外，主把神所赐与祂的道，赐给属神的人，借此信徒认识基督是天上父神所差遣的（17：8）。主有效的引领人归向父神。最后，主使属神的子民领受了神的说话，并且愿意遵守神的道（17：6，8）。
祷告的内容（17：9至19）
主耶稣为门徒献上祷告，因为他们是属于父的，也是属于基督的，表明圣子与圣父，是同尊、同荣及同等的。基督的荣耀故然是源自父，为何主说从他们的身上得了荣耀呢（17：10）？在旧约时代，神与祂的子民同在，显出祂的荣耀（出40：34至38）。在教会时代里，圣灵高举及荣耀圣子（约16：14），并且属神的子民活在世上的主要目的，乃是要见证复活的基督（徒1：8），借此荣耀主的名（弗1：12）。现今基督为十一个门徒祷告，有两个重点：第一，求神保守他们（17：11）。第二，求神使他们成圣（17：17）。
保守门徒（17：11至16）
像圣父与圣子一样
主求父保守门徒合而为一，像圣父与圣子一样。世人喜欢结党纷争，但属主的人绝不可以这样，分党分派，分裂神的家，这绝对不是神的旨意。这十一个初期教会的领袖，绝不可有任何纷争及分裂；因此，主特意的求父保守他们，使他们同心，竭力保守圣灵所赐合而为一的心（弗4：3）。
魔鬼的工作
此外，主求父神保守他们，护卫他们，因为魔鬼的工作实在厉害。犹大就成了被魔鬼利用的工具，成为了灭亡之子（17：12）。由于门徒不属世界；故此，会遭受世人的苦待，但主把属祂的喜乐赐下（17：13），让他们有力量可胜过恶势力。门徒在名义上、地位上，虽不属这世界，但毕竟仍要住在世上，继续为主作见证；因此，主为他们代求，使他们不受世上罪恶的影响。
圣洁生活（17：17至19）
真理叫人成圣，使人站在圣洁的地位上，不仅是地位的问题，乃是实际行事为人方面，要活出主的圣洁，过一个圣洁的生活。从主的祷告中，清楚看见一个重要的真理：若要胜过邪恶的生活，属主的人需过一个分别为圣的生活。
为信徒代祷（17：20至26）
留意第二十节，主不再为那十一位门徒代祷了，现今转到为那些因门徒的见证而接受真理的信徒代祷。主再次为信徒的合一代祷（17：21至23），可见合一的重要性。此外，主求父使这些人明白祂的爱，让属神的人明白神的爱是何等长阔高深，神爱信徒如同祂爱圣子一样（17：23）。并且，求神保守这些人，不会离开这救恩，直至见主的面（17：24）。再者，求父让信徒明白，父是怎样爱子，并且这爱可存在他们的心中（17：26）。
2) 客西马尼的祷告（太26：36至46；可14：32至42；路22：39至46；约18：1）
祷告的原因
主耶稣带着十一位门徒，前往橄榄山上靠近一个名叫客西马尼园的地方，这是主及众门徒常到之处（路22：39）。主吩咐门徒要祷告，免得入了迷惑（路22：40）。于是便带同彼得、雅各及约翰，前往客西马尼园内，把心事告诉这几位门徒。为何只告诉这几个门徒，圣经没有交待其原因。或许与这三人比较成熟有关。福音书把主当时的心情记下来，祂是「忧伤起来」、「极其难过」（太26：37；可14：33）、「惊恐起来」、「甚是忧伤，几乎要死」（可14：33）。面对前面十字架的苦难，主忧伤、极其难过、惊恐，忧伤的苦况，叫祂十分难受。祂向三位门徒敞开内心世界，提醒他们要与祂一同儆醒（太26：38）。可悲的是，这三位门徒不但没有儆醒祷告，甚至竟打了瞌睡（可14：37，40）。他们不但不能成为主的支持及鼓励，反成了祂的重担。
什么是「苦杯」？为何主耶稣要三次求父把「苦杯」取去呢？虽然至今仍没有一个最妥善的解释，但神学家及释经家提供了最少有以下三种的解释：
第一种解释
「苦杯」是指着耶稣基督肉身的死亡而论的。这个讲法有欠缺妥善的地方。耶稣基督在世上时，是神人结合在一体；简单来说，普遍正统的神学家认为主的神性及人性绝不能分开。基于以上的定义，主没有可能按着祂人性的软弱，求父把十架所带来肉身的苦楚除去。此外，主经常提及有关祂的受害（可10：33至34），加上表明祂必须完成这救赎的工作（可10：45；路19：10），显示主对肉身的死亡，不是那么的惧怕。因此，可见这论调是有不足及矛盾的地方。
第二种解释
这种讲法，认为主惧怕时机未到自己就要死了，以致不能完成这救赎的工作。故此，主在客西马尼园中，求神保守，免得撒但在这园中治死祂。这派学者认为，撒但要对付主耶稣，在时机未成熟前把祂杀害。我们不会完全否定，在客西马尼园中有魔鬼的工作，但我们可以肯定的是鬼王没有权取去主的生命，是主自己甘愿舍去的（约10：17至18）。以上的讲法，实在无法可接受。
第三种解释
希伯来书第五章七节的记述，应是主在客西马尼园祷告时补充性的描绘。这处的经文，说「因祂的虔诚，蒙了应允」。若「苦杯」是指肉身死亡的话，那么主就不用死了。在圣经内，提及有两种的死亡。第一种，是灵性的死亡。亚当、夏娃犯罪后，没有即时在肉身上死亡（创2：17），神所指的死，乃是灵性的死亡。第二种，乃是肉身上的死亡。主耶稣三次求父把「苦杯」撤去，因为祂惧怕「灵性」及「肉身」的死亡。难怪主在十架上，大声喊叫，「我的神，我的神，为什么离弃我？」（太27：45）灵性的死亡，意即与神隔绝，与祂断绝相交的意思。对圣洁、完全没有瑕疵的耶稣基督来说，简直是苦不堪言，难以接受、极其难过的经历。肉身的死亡，故然是痛苦，加上灵性的死亡，难怪主恳求父把这苦楚除掉！
祷告的次数
主三次向父神求告，恳求神把苦杯撤去。三次祷告的内容是一致的（太26：44）。从祷告的次数看，这苦杯所带来的苦楚非常大，否则主断不会这样向父求。
祷告的迫切
即使父神差派天使到主的旁边，加添祂的力量，基督仍然显出极其伤痛，祷告之际，汗珠如大血点（路22：44），从路加医生这个独特的描写来看，显示主祷告时的迫切。
祷告的重点
在祷告里主有很大的挣扎，求父把苦杯撤去，但在灵里的斗争中，主愿意放下自己的意思，完完全全顺服及拣选父神的旨意。
门徒的软弱
雅各、约翰、彼得为何不能儆醒祷告呢？路加交待了其中一个主要的原因，门徒是基于忧伤的缘故打了瞌睡（22：45），难道人忧伤便打瞌睡？他们获知主快要受害，以致心灵极其伤痛。由于伤心过度，耗尽心力，使身心灵都极度疲倦，所以没有精力能与主一同儆醒祷告。马太及马可则交待另一个原因，这三位门徒在心态上，是愿意与主一同守望，但基于人肉体的限制，才软弱失败。
[1] 太26：36至46；可14：32至42；路22：39至46；约17：1至18：1
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